SMA Negeri 4 Balikpapan didirikan pada tahun 1985 yang awalnya berdomisili di Jalan Marsma R. Iswahyudi. Setahun kemudian, SMA Negeri 4 menempati gedung baru di Jalan Sepinggan Baru III No. 36 ini sampai sekarang. Pimpinan sekolah yang pernah bertugas di SMA Negeri 4 sejak awal berdirinya (1986) adalah:
DAFTAR KEPALA SMA NEGERI 4 BALIKPAPAN
- Ruslan (1986 s.d. 1996)
- P.Simanullang, MMPd. (1996 s.d. 2006)
- P. Sapan Tanduk (2006 s.d. 2010)
- Muhammad Yakub Syam, S.Pd, M. Pd. (2010 s.d. 2012)
- Stia Kawan Raharjo, M.M. (2012 s.d. 2014)
- Heru Marsono, MM. (2014 s.d. sekarang)